A közös ügyek között sajátos színfoltot képviselt a hadügy, mert Ferenc József számára, érthető okokból, a hadsereggel összefüggő kérdések különös jelentőséggel bírtak. A XII. törvénycikk a közös védelem külügy melletti másik eszközeként nevezi meg, s a 11.§-ban kijelenti: "Ő felségének a hadügy körébe tartozó alkotmányos fejedelmi jogai folytán mindaz, ami az egész hadseregnek és így a magyar hadseregnek is, mint az összes hadsereg kiegészítő részének egységes vezérletére és vezényletére és belszervezetére vonatkozik. Ő felsége által intézendőnek ismertetik el." E tekintetben tehát a közösügyes elképzelés helyett a birodalmi érvényesült, s az országgyűlés az uralkodói rezervátát (felségjogot) szentesítette. A paragrafus értelmében az uralkodó lett a legfőbb hadúr, aki gyakorolta a haderőnek háborúban való vezetését és az ezzel való rendelkezését (vezérletét), a legfőbb parancsnoklási jogot és fegyelmi hatalmat (vezénylet) valamint a kinevezésre, a csapatok elhelyezésére, a katonai hatóságok és fegyvernemek megállapítására vonatkozó jogot (belszervezet).
Ferenc Józsefnek a hadsereggel kapcsolatos jogkörét a "magyar hadsereg", a 100 -100 ezer főnyi Honvédség és a Lajtán túli Landwehr (a magyar honvédségnek felelet meg) tekintetében sem kellett megosztania. E kettő esetében a különbség annyi volt, hogy függetlenek voltak a közös hadügyminisztériumtól. A horvát egységekkel kiegészített magyar honvédség "az összes hadsereg kiegészítő része" lett, nehézfegyverzettel nem, csak gyalogsággal és lovassággal rendelkezett, állományát pedig csupán a közös hadsereg feltöltése után lehetett újoncokkal kiegészíteni. A császári és királyi (Kaiserlich und Königlich - K. u K) hadsereg létszáma 800 ezer fő volt, s 1868 után az általános hadkötelezettség alapján egészítették ki. Emelett mindkét fél rendelkezett - mintegy "harmadik vonalbeli tartalékként" - népfelkelőkkel is. A hadkötelezettség a 21 esztendős kor elérése után kezdődött, az újonc három évet tényleges szolgálatban vagy kettőt a honvédség kötelékében, hetet pedig tartalékban töltött.